MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
2	NC_017474	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	385821701
3	NC_017474	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	385821701
4	NC_017474	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821701
5	NC_017474	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	385821701
6	NC_017474	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
7	NC_017474	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
8	NC_017474	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821701
9	NC_017474	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	385821701
10	NC_017474	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821701
11	NC_017474	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
12	NC_017474	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821701
13	NC_017474	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	385821701
14	NC_017474	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
15	NC_017474	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
16	NC_017474	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	385821701
17	NC_017474	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	385821701
18	NC_017474	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
19	NC_017474	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	385821701
20	NC_017474	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	385821701
21	NC_017474	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	385821701
22	NC_017474	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
23	NC_017474	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	385821701
24	NC_017474	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	385821701
25	NC_017474	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
26	NC_017474	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	385821701
27	NC_017474	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	385821701
28	NC_017474	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821701
29	NC_017474	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	385821701
30	NC_017474	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
31	NC_017474	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821702
32	NC_017474	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
33	NC_017474	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	385821702
34	NC_017474	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821702
35	NC_017474	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
36	NC_017474	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
37	NC_017474	A	6	6	2256	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	385821702
38	NC_017474	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
39	NC_017474	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
40	NC_017474	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
41	NC_017474	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821702
42	NC_017474	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
43	NC_017474	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
44	NC_017474	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821703
45	NC_017474	T	6	6	3619	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	385821703
46	NC_017474	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821703
47	NC_017474	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821703
48	NC_017474	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	385821703
49	NC_017474	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
50	NC_017474	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
51	NC_017474	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	385821704
52	NC_017474	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
53	NC_017474	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
54	NC_017474	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	385821704
55	NC_017474	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821704
56	NC_017474	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
57	NC_017474	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
58	NC_017474	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
59	NC_017474	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	385821704
60	NC_017474	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
61	NC_017474	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
62	NC_017474	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
63	NC_017474	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
64	NC_017474	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
65	NC_017474	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
66	NC_017474	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
67	NC_017474	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
68	NC_017474	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
69	NC_017474	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
70	NC_017474	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
71	NC_017474	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
72	NC_017474	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
73	NC_017474	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	385821705
74	NC_017474	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	385821705
75	NC_017474	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
76	NC_017474	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
77	NC_017474	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	385821705
78	NC_017474	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
79	NC_017474	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
80	NC_017474	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
81	NC_017474	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	385821705
82	NC_017474	TTGAAG	2	12	5260	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
83	NC_017474	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821705
84	NC_017474	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
85	NC_017474	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
86	NC_017474	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
87	NC_017474	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
88	NC_017474	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	385821705
89	NC_017474	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
90	NC_017474	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821705
91	NC_017474	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	385821705
92	NC_017474	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
93	NC_017474	A	6	6	5790	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	385821705
94	NC_017474	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	385821705
95	NC_017474	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
96	NC_017474	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
97	NC_017474	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
98	NC_017474	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
99	NC_017474	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
100	NC_017474	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
101	NC_017474	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
102	NC_017474	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
103	NC_017474	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	385821705
104	NC_017474	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
105	NC_017474	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821705
106	NC_017474	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821705
107	NC_017474	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
108	NC_017474	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821705
109	NC_017474	CCGATG	2	12	6583	6594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385821705
110	NC_017474	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
111	NC_017474	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
112	NC_017474	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	385821705
113	NC_017474	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821705
114	NC_017474	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
115	NC_017474	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
116	NC_017474	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	385821705
117	NC_017474	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
118	NC_017474	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
119	NC_017474	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821706
120	NC_017474	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	385821706
121	NC_017474	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821706
122	NC_017474	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
123	NC_017474	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821706
124	NC_017474	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821706
125	NC_017474	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	385821706
126	NC_017474	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
127	NC_017474	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
128	NC_017474	TTG	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
129	NC_017474	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	385821706
130	NC_017474	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
131	NC_017474	CCG	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821706
132	NC_017474	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821706
133	NC_017474	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	385821706
134	NC_017474	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	385821706
135	NC_017474	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821706
136	NC_017474	ATC	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
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169	NC_017474	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	385821707
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257	NC_017474	CTT	2	6	15708	15713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821714
258	NC_017474	CAT	2	6	15726	15731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821714
259	NC_017474	T	6	6	15812	15817	0 %	100 %	0 %	0 %	385821714
260	NC_017474	CAAT	2	8	15836	15843	50 %	25 %	0 %	25 %	385821714
261	NC_017474	TTA	2	6	15913	15918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821714
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263	NC_017474	CAG	2	6	15989	15994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821714
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